目前，我国栽培蕈菌共计计 4 纲 , 14 目 , 31科 , 61属。分类地位如下： 

 

1.子囊菌亚门

1.1 核菌纲

麦角菌目

麦角菌科

虫草属

麦角菌属

      座囊菌目 

          格孢腔菌科 

              竹黄属 

1.2盘菌纲

盘菌目

       盘菌科 

          盘菌属 

       羊肚菌科 

          羊肚菌属 

       地菇科 

          地菇属 

       块菌科 

          块菌属 

2.担子菌亚门

2.1 层菌纲

   银耳目 

       银耳科 

          银耳属 

木耳目

       木耳科 

          银耳属 

   非褶菌目 

       猴头菌科 

猴头属

牛舌菌科

牛舌菌属

革菌科

革菌属

齿菌科

齿菌属

灵芝科

灵芝属

多孔菌科

茯苓属

殉孔菌属

棱孔菌属

树花属

小香菇属Lentinus

侧耳属

多孔菌属

栓菌属

韧革菌科

胶韧革菌属

裂褶菌科

裂褶菌属

锈球菌科

锈球菌属

   鸡油菌目 

       鸡油菌科 

          鸡油菌属 

   口蘑目 

       鹅膏菌科 

鸡枞菌属

鹅膏菌属

口蘑科

口蘑属

金钱菌属

离褶伞属

杯伞属

假蜜环菌属

蜜环菌属

金钱菌属

亚侧耳属

玉蕈属

香菇属Lentinula

小皮伞属

香蘑属

小奥德蘑属

伞菌目

光柄菇科

小包脚菇属

伞菌科

蘑菇属

环柄菇属

丝膜菌科

粘滑菇属

鬼伞科

鬼伞属

小脆柄菇属

球盖菇科

鳞伞属

垂幕菇属

球盖菇属

库恩菇属

粪伞科

田头菇属

红菇目

红菇科

红菇属

乳菇属

牛肝菌目

牛肝菌科

牛肝菌属

2.2腹菌纲

鬼笔目

鬼笔科

鬼笔属

竹荪属

内笔菌属

马勃目

马勃科

马勃属

秃马勃属

腹菌目

腹菌科

须腹菌属